More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0321 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  41.75 
 
 
214 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  36.19 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.44 
 
 
346 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  37.44 
 
 
354 aa  144  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  35.5 
 
 
218 aa  136  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
236 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 
210 aa  135  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.83 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 
229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  34.01 
 
 
258 aa  128  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  33.65 
 
 
248 aa  128  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 
251 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 
210 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.19 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  35.75 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  33.17 
 
 
245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.3 
 
 
207 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  34.31 
 
 
229 aa  124  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  33.82 
 
 
235 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  33.82 
 
 
235 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 
206 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  34.69 
 
 
207 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  33.68 
 
 
237 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.55 
 
 
235 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
213 aa  122  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
208 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
344 aa  121  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 
213 aa  121  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 
361 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
213 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  38.39 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  35.96 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
220 aa  118  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  30.66 
 
 
237 aa  118  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  38.37 
 
 
254 aa  117  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  36.16 
 
 
246 aa  117  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  30.05 
 
 
232 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  35.47 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  32.04 
 
 
345 aa  117  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  32.69 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  31.02 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  29.72 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  29.27 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  35.41 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.82 
 
 
471 aa  115  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.2 
 
 
226 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
249 aa  114  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  31.73 
 
 
250 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  31.53 
 
 
233 aa  114  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  31.53 
 
 
233 aa  114  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 
467 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  32.16 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.98 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  29.41 
 
 
249 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 
205 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.58 
 
 
229 aa  112  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
209 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
212 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 
461 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 
238 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  34.18 
 
 
229 aa  112  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  32.54 
 
 
209 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
471 aa  111  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  30.24 
 
 
346 aa  111  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.9 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.67 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.31 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  29.27 
 
 
346 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.11 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.24 
 
 
233 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  33.18 
 
 
456 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 
239 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 
235 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 
444 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  30.85 
 
 
249 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  32.29 
 
 
209 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  30.77 
 
 
233 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.73 
 
 
472 aa  105  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
242 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  28.12 
 
 
228 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  30.32 
 
 
249 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.5 
 
 
213 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  30.22 
 
 
459 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
244 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>