More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2397 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  70.24 
 
 		 207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  66.83 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  65.7 
 
 		 209 aa  282  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  70.35 
 
 		 204 aa  281  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  63.9 
 
 		 208 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  61.29 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  63.9 
 
 		 205 aa  271  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  63.21 
 
 		 213 aa  266  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  62.38 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  58.57 
 
 		 210 aa  264  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  61.9 
 
 		 209 aa  264  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  62.14 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  60.48 
 
 		 210 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  60.48 
 
 		 210 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  60.48 
 
 		 210 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  63 
 
 		 202 aa  261  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  60.95 
 
 		 209 aa  260  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  64.62 
 
 		 202 aa  258  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  60.66 
 
 		 211 aa  257  9e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  64.18 
 
 		 204 aa  257  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  65.13 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  57.79 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  60.78 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  62.25 
 
 		 211 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  58.97 
 
 		 574 aa  238  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  57.55 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  53.96 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  56.19 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  55.94 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  53.23 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  45.32 
 
 		 235 aa  175  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  41.96 
 
 		 235 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  44.33 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  45.74 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  39.41 
 
 		 339 aa  147  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  37.44 
 
 		 275 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  38.83 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  39.38 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.34 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  37.7 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  39.57 
 
 		 251 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  38.95 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  40.43 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  37.76 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  40.39 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.42 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  36.9 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  36.53 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  39.58 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  40.4 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  39.47 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  33.85 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  38.55 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  39.9 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  35.64 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.82 
 
 		 229 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.11 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.26 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  33.16 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  37.89 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  36.65 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  37.7 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.27 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  36.84 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  36.98 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  35.18 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  37.06 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  35.6 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  36.17 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  36.22 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  38.27 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2926  beta-lactamase domain-containing protein  55.06 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.07 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  35.91 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>