More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3443 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  83.73 
 
 
209 aa  364  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  82.78 
 
 
209 aa  359  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  81.73 
 
 
211 aa  348  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  65.38 
 
 
208 aa  269  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  61.27 
 
 
205 aa  268  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  60.48 
 
 
210 aa  263  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  59.61 
 
 
208 aa  255  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  59.33 
 
 
210 aa  251  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.34 
 
 
208 aa  241  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  57.56 
 
 
209 aa  240  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  58.79 
 
 
204 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.81 
 
 
218 aa  236  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  60.82 
 
 
202 aa  235  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  57.75 
 
 
215 aa  232  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  57.28 
 
 
216 aa  232  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  53.81 
 
 
228 aa  231  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  57.51 
 
 
206 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  58.05 
 
 
207 aa  230  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  55.02 
 
 
213 aa  230  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  55.61 
 
 
206 aa  226  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  57.64 
 
 
207 aa  225  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  58.55 
 
 
202 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  58.03 
 
 
574 aa  224  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  54.76 
 
 
211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.78 
 
 
204 aa  218  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  54.87 
 
 
205 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  56.7 
 
 
220 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  45.32 
 
 
235 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  41.44 
 
 
235 aa  161  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  46.99 
 
 
209 aa  158  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  43.35 
 
 
238 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  42.78 
 
 
195 aa  141  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  39.41 
 
 
339 aa  141  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  37.93 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.23 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
208 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 
212 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.17 
 
 
209 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
212 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.68 
 
 
229 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  38.42 
 
 
217 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.64 
 
 
201 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 
198 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  32.65 
 
 
207 aa  101  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 
210 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 
221 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 
201 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  34.74 
 
 
219 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  31.09 
 
 
208 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  31.09 
 
 
208 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  35.79 
 
 
209 aa  99  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  36.51 
 
 
204 aa  99  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.68 
 
 
207 aa  99  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
210 aa  98.6  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 
207 aa  98.6  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 
207 aa  98.6  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 
251 aa  98.6  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  34.22 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.36 
 
 
214 aa  98.2  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  35.79 
 
 
208 aa  98.2  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  29.38 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  36.41 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  36.1 
 
 
229 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.25 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  36.93 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.57 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.25 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  29.38 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  29.38 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 
209 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.04 
 
 
226 aa  95.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 
222 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 
218 aa  94  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.26 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  35.59 
 
 
232 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  32.12 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  30.21 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  30.21 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 
218 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 
209 aa  92  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
209 aa  92  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
216 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
208 aa  91.3  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  31.49 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.58 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>