More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0656 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  69.76 
 
 		 205 aa  289  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  66.83 
 
 		 210 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  63.94 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  66.83 
 
 		 209 aa  278  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  65.38 
 
 		 209 aa  271  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  65.38 
 
 		 210 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  65.38 
 
 		 210 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  65.38 
 
 		 210 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  64.9 
 
 		 209 aa  268  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  63.73 
 
 		 208 aa  267  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  61.47 
 
 		 218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  65.33 
 
 		 204 aa  264  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  62.33 
 
 		 211 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  61.9 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  65.37 
 
 		 207 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  66.83 
 
 		 204 aa  256  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  60.91 
 
 		 206 aa  251  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  64.77 
 
 		 202 aa  247  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  59.42 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  58.94 
 
 		 215 aa  245  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  59.39 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  65.28 
 
 		 202 aa  244  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  61.54 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  63.21 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  58.05 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  61.27 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  58.65 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  61.66 
 
 		 220 aa  227  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  59.47 
 
 		 574 aa  224  7e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  47.76 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  51.61 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  46.27 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 235 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  46.28 
 
 		 195 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  38.73 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  33.82 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  40.4 
 
 		 251 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  43.32 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  41.03 
 
 		 208 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.31 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  36.65 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  37.37 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  39.04 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  38.74 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  39.18 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  39.9 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  40.53 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.82 
 
 		 229 aa  114  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.1 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  36.59 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  36.32 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  39.69 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  39.57 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36.22 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  42.46 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.9 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  37.23 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  37.17 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  38.07 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  39.29 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  35.64 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  38.22 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  35.64 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  41.49 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  35.42 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  38.74 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 		 216 aa  104  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  40.43 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  37.43 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  32.64 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  38.02 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  41.01 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  37.43 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  38.3 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  37.14 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  37.69 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  36.6 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.51 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.51 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.51 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.51 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.51 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>