More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0909 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 213 aa  420  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  60.09 
 
 		 208 aa  267  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  63.21 
 
 		 210 aa  266  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  61.9 
 
 		 208 aa  259  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  64.19 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  64.29 
 
 		 207 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.62 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  58.37 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  63.94 
 
 		 204 aa  248  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  59.81 
 
 		 209 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  58.37 
 
 		 209 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  63 
 
 		 207 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  53.11 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.31 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.71 
 
 		 228 aa  236  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  57.21 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  58.74 
 
 		 204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  55.02 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  55.02 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  55.02 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  57.43 
 
 		 574 aa  229  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  57.49 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  58.94 
 
 		 202 aa  225  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  57.43 
 
 		 202 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  51.4 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  56.52 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  51.92 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  53.11 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  50.7 
 
 		 216 aa  205  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  49.04 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  44.39 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  36.4 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  42.65 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  45.03 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  44.27 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  34.76 
 
 		 275 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  35.58 
 
 		 339 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  40.62 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.09 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  34.9 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  35.57 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  36.26 
 
 		 232 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  31.61 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  33 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  33 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  35.35 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  37.19 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  33.66 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.34 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.34 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.2 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.5 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 		 251 aa  92.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  36.82 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 		 216 aa  91.7  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  37.37 
 
 		 229 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  30.39 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  30.39 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.63 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  35.53 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.5 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  37.29 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  32.8 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.1 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  28.72 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  33.66 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>