More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2995 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  63.64 
 
 		 225 aa  276  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  60.45 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  60.91 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  60 
 
 		 217 aa  255  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  62.62 
 
 		 203 aa  254  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  58.9 
 
 		 229 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  55.11 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  57.66 
 
 		 218 aa  237  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  55.45 
 
 		 216 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  56.82 
 
 		 213 aa  235  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  56.36 
 
 		 222 aa  231  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  54.26 
 
 		 221 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  53.64 
 
 		 214 aa  227  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  55.2 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  51.95 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.54 
 
 		 237 aa  218  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  53.64 
 
 		 218 aa  218  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  56.14 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  54.95 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  54.95 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  54.5 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  52.51 
 
 		 226 aa  213  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  53.49 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  54.95 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  55.86 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  52.38 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.33 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.1 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  53.3 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  48.02 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.77 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.28 
 
 		 214 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  40.49 
 
 		 195 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  45.5 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  40.2 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  34.13 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.89 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  32.72 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  33.33 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  34.78 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  32.35 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 		 213 aa  94.7  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.93 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.71 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.17 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  35.07 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.72 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.43 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 		 206 aa  91.7  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.34 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.65 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  34.13 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  33.03 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  34.7 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  36.98 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  33.79 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  29.58 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.37 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  33.79 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  34.69 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  38.3 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  35.68 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  31.78 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  34.47 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.66 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 213 aa  85.5  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 214 aa  85.1  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.96 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  31.78 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  33.64 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  35.86 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.38 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>