More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5618 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  51.47 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  51.22 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  49.05 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  49.53 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  47.62 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  45.71 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  47.8 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  47.83 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  44.55 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  46.7 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.28 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  48.21 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  46.54 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  44.71 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  46.73 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  45.5 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  42.72 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  40.95 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  40.8 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  43.3 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  39.3 
 
 		 216 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  42.19 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  41.67 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  40.43 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  41.38 
 
 		 264 aa  101  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.12 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.22 
 
 		 238 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.16 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.89 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  36.81 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  25.96 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  35.71 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  25.24 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  28.14 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.14 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.9 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  27.94 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  28.29 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  29.08 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  33.33 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  30.73 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  22.55 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  26.77 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  29.53 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 467 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.14 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  30.73 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  28.14 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  27.84 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.32 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.23 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  27.09 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  24.02 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  27.98 
 
 		 345 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  30.17 
 
 		 574 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 		 303 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  29.85 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.15 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  28.43 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  29.15 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 344 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>