More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0946 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 467 aa  958    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  56.58 
 
 		 472 aa  512  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  52.75 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  53.29 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  51.21 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  53.51 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  50.77 
 
 		 470 aa  475  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  52.41 
 
 		 471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  49.67 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.59 
 
 		 471 aa  415  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  43.9 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  43.9 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  43.3 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  43.3 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  43.3 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  43.52 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  40.26 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  39.1 
 
 		 459 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  39.17 
 
 		 460 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  38.9 
 
 		 472 aa  295  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  37.67 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 		 617 aa  286  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  36.46 
 
 		 469 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  36.58 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 		 464 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.08 
 
 		 480 aa  275  9e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  38.07 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  36.58 
 
 		 471 aa  266  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 		 467 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  36.12 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.46 
 
 		 480 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 470 aa  257  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 		 466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  34.7 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  34.7 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  34.39 
 
 		 479 aa  249  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.68 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.27 
 
 		 456 aa  246  6e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  36.42 
 
 		 464 aa  242  7.999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  34.46 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 		 476 aa  240  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  33.69 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.16 
 
 		 484 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.16 
 
 		 484 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.51 
 
 		 478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.95 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.7 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  31.74 
 
 		 478 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  32.89 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  34.53 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  33.99 
 
 		 450 aa  223  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.32 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  32.43 
 
 		 453 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 453 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 453 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 455 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 469 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 		 453 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  33.91 
 
 		 484 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.4 
 
 		 502 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  33.04 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.22 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  30.55 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 		 476 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  30.91 
 
 		 446 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 480 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 488 aa  183  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 489 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 		 454 aa  176  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  31.26 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  39.57 
 
 		 244 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  38.62 
 
 		 244 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  29.68 
 
 		 354 aa  140  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  36.8 
 
 		 246 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 454 aa  133  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 		 243 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  29.11 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  28.3 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  29.11 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  30.06 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  35.34 
 
 		 243 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  30.57 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 		 243 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 		 243 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 213 aa  123  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>