More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6177 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  67.69 
 
 		 466 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 470 aa  970    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  63.3 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  64.29 
 
 		 463 aa  616  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  61.41 
 
 		 470 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  59.01 
 
 		 471 aa  580  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  58.26 
 
 		 470 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  59.96 
 
 		 471 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  55.63 
 
 		 472 aa  536  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  56.17 
 
 		 471 aa  532  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  53.51 
 
 		 467 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  41.43 
 
 		 459 aa  346  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  41.43 
 
 		 459 aa  346  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  40.13 
 
 		 459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  40.83 
 
 		 459 aa  334  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  40.83 
 
 		 459 aa  334  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  40.83 
 
 		 459 aa  334  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  40.17 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  39.61 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  37.11 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  36.23 
 
 		 472 aa  287  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  37 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 		 460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 480 aa  274  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  39.09 
 
 		 456 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  34.81 
 
 		 617 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  35.12 
 
 		 444 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  36.66 
 
 		 467 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  34.83 
 
 		 442 aa  250  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 		 464 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 450 aa  246  9e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.3 
 
 		 478 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 		 478 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  33.26 
 
 		 471 aa  239  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  33.47 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  35.45 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 484 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.13 
 
 		 478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 484 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 476 aa  233  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.4 
 
 		 478 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.71 
 
 		 456 aa  233  7.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  34.53 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  34.42 
 
 		 484 aa  230  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 		 478 aa  227  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  33.05 
 
 		 442 aa  227  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  33.55 
 
 		 479 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 480 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  33.41 
 
 		 448 aa  220  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  33.76 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 453 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  31.21 
 
 		 453 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 453 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  33.26 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  33.55 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 455 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  32.01 
 
 		 472 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 476 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.41 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.67 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 451 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.58 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 		 478 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  40.93 
 
 		 244 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 		 466 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  38.36 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.53 
 
 		 243 aa  144  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  39.59 
 
 		 244 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  40.2 
 
 		 251 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 		 243 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  36.48 
 
 		 243 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 		 243 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 		 454 aa  123  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  29.79 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  28.14 
 
 		 346 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 		 378 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  34.5 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 213 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>