More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1960 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 478 aa  959    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  89.38 
 
 		 452 aa  795    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  57.62 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  52.71 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  52.11 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  51.79 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  52.71 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  51.89 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  52.71 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  52.24 
 
 		 476 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  52.34 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.11 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  50.43 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  50.98 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  51.54 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.92 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  40.24 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  36.2 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 		 480 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 		 480 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 		 466 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  35.04 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  35.04 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34.79 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 		 459 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  36.74 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  34.19 
 
 		 476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  34.84 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  31.11 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  34.99 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  31.62 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  33.25 
 
 		 461 aa  189  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 		 617 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  33.71 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.38 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 		 470 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  30.5 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.38 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.48 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.38 
 
 		 478 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  31.51 
 
 		 457 aa  177  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  29.16 
 
 		 478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.81 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  32.05 
 
 		 479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 		 466 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  25.6 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 		 476 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  33.26 
 
 		 472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 471 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  26.98 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.39 
 
 		 502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 		 471 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.5 
 
 		 471 aa  149  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 469 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  31.41 
 
 		 470 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.93 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.51 
 
 		 470 aa  137  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  28.92 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 		 489 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 		 244 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 		 246 aa  99.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  34.1 
 
 		 251 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  32.84 
 
 		 244 aa  97.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 369 aa  97.1  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  34.95 
 
 		 250 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.08 
 
 		 239 aa  95.1  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  27.95 
 
 		 354 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.04 
 
 		 243 aa  93.6  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  33.91 
 
 		 249 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 243 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  34.01 
 
 		 246 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  34.01 
 
 		 246 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>