More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0108 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 454 aa  914    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  59.29 
 
 		 453 aa  528  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  53.67 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  52.68 
 
 		 453 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  52.68 
 
 		 453 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  52.68 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  51.21 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  51.92 
 
 		 478 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  51 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  52.64 
 
 		 471 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  50.99 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  50.66 
 
 		 452 aa  408  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.91 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  47.45 
 
 		 470 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  47.2 
 
 		 470 aa  358  9e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 		 466 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  40.19 
 
 		 454 aa  279  6e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  36.42 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 		 480 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34.9 
 
 		 471 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  32.64 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  35.97 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  33.41 
 
 		 466 aa  196  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 		 463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 617 aa  183  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  30.7 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32.41 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 		 467 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.27 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  32.36 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  32.34 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  28 
 
 		 478 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  27.37 
 
 		 478 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.37 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  30.84 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.64 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 		 476 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  27.79 
 
 		 484 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  27.79 
 
 		 484 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.85 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 478 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  31.35 
 
 		 459 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  28.35 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 		 459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.34 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  31.29 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 450 aa  159  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  25.69 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  31.36 
 
 		 457 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  27.02 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.83 
 
 		 470 aa  153  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.19 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 476 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 		 469 aa  150  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  25.23 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  32.33 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.57 
 
 		 502 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.89 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  27.4 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 		 375 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  32.42 
 
 		 391 aa  101  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  24.83 
 
 		 489 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 488 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0867  metallo-beta-lactamase family protein  31.09 
 
 		 376 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 244 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4505  metallo-beta-lactamase family protein  31.36 
 
 		 378 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000320753 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0831  metallo-beta-lactamase family protein  30.25 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00416077  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 243 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  34.25 
 
 		 251 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 243 aa  90.5  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  29.83 
 
 		 376 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  29.83 
 
 		 376 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  29.83 
 
 		 376 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 369 aa  90.1  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  30.51 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>