More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1900 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
446 aa  867    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  67.43 
 
 
451 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 
455 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  38.32 
 
 
450 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  38.2 
 
 
453 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  38.2 
 
 
453 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  38.2 
 
 
453 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.83 
 
 
456 aa  245  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  39.55 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  39.73 
 
 
471 aa  242  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 
452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 
470 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  38.2 
 
 
452 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  37.01 
 
 
470 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.53 
 
 
453 aa  226  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 
454 aa  223  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  36.93 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 
472 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 
466 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 
467 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.99 
 
 
480 aa  193  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.05 
 
 
472 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  31.87 
 
 
455 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.05 
 
 
480 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 
470 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 
459 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 
459 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 
469 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  32.83 
 
 
470 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
459 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
459 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
459 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 
476 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 
471 aa  183  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 
459 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  29.54 
 
 
471 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34.37 
 
 
459 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
476 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.44 
 
 
471 aa  172  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  28.6 
 
 
471 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 
470 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  30.94 
 
 
450 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 
460 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
466 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 
459 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
617 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 
466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 
464 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 
464 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
470 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  28.54 
 
 
467 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  30.41 
 
 
456 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 
480 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 
461 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  26.33 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  31.39 
 
 
479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.45 
 
 
478 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.11 
 
 
478 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  26.33 
 
 
484 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.45 
 
 
478 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  26.33 
 
 
484 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  26.45 
 
 
478 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  31.85 
 
 
457 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  26.46 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.9 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  33.11 
 
 
472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  30.86 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 
469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.43 
 
 
502 aa  142  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  33.71 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  24.61 
 
 
442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
444 aa  140  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
444 aa  140  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 
450 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
484 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  29.98 
 
 
453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 
489 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.73 
 
 
471 aa  133  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  25.69 
 
 
448 aa  127  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.23 
 
 
470 aa  124  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  39.55 
 
 
243 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 
246 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  36.15 
 
 
244 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  33.94 
 
 
244 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  36.07 
 
 
251 aa  97.8  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 
243 aa  94.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  27.43 
 
 
235 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  27.43 
 
 
235 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 
243 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 
379 aa  87.4  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
243 aa  87  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0867  metallo-beta-lactamase family protein  27.16 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  36.81 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>