More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 453 aa  902    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  59.29 
 
 		 454 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  50.34 
 
 		 452 aa  425  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  49.89 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  49.12 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  48.67 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  49.67 
 
 		 452 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  49.12 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  48.9 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  48.9 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  50.11 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  50.33 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  44.78 
 
 		 456 aa  361  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  46.24 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  45.89 
 
 		 470 aa  343  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 		 466 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 		 454 aa  253  6e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  37.53 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  38.17 
 
 		 451 aa  223  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.71 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 		 480 aa  216  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  33.78 
 
 		 456 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  31.6 
 
 		 472 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 		 471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 469 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  35.94 
 
 		 484 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 		 617 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  34.7 
 
 		 460 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34.54 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  33.93 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 		 459 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 		 466 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32.59 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  32.58 
 
 		 450 aa  189  9e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 467 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 		 470 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.66 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 		 444 aa  187  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  32.27 
 
 		 457 aa  186  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.16 
 
 		 478 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.62 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.82 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  27.73 
 
 		 442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 476 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  27.62 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 		 450 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  35.84 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  27.62 
 
 		 484 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  27.62 
 
 		 484 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.09 
 
 		 472 aa  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 		 459 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.04 
 
 		 459 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 		 459 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  33.56 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  33.56 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.7 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  26.92 
 
 		 448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.41 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  33.83 
 
 		 472 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.98 
 
 		 502 aa  159  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.56 
 
 		 470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  33.26 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  30.4 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 244 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1932  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  34.1 
 
 		 251 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  35.54 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.9 
 
 		 243 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  34.58 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  30.51 
 
 		 391 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  33.95 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 		 369 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1187  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>