More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1014 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 454 aa  920    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  40.6 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  39.43 
 
 		 450 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  38.82 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  38.82 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  38.82 
 
 		 453 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  40.37 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 		 476 aa  285  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  42.18 
 
 		 471 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 478 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.55 
 
 		 453 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 		 470 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 		 470 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  38.32 
 
 		 466 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  36.18 
 
 		 451 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 469 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  32.38 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  32.27 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.24 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  30.75 
 
 		 484 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  30.28 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 		 470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 459 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.48 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  30.81 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.29 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 476 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.65 
 
 		 472 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.05 
 
 		 478 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  26.62 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  28.19 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.05 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  28.19 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  29.36 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 617 aa  147  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.04 
 
 		 471 aa  146  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  30.3 
 
 		 464 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  26.48 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 467 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  25.45 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 		 469 aa  140  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 471 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  24.94 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  27.13 
 
 		 470 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.68 
 
 		 470 aa  136  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.6 
 
 		 502 aa  136  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  28.38 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 466 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  27.57 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  24.66 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.33 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 489 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  34.19 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 243 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  39.29 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 243 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 246 aa  97.4  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 		 243 aa  97.1  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  34.4 
 
 		 251 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  32.73 
 
 		 244 aa  93.2  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 		 244 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  27.8 
 
 		 235 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  27.8 
 
 		 235 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2930  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>