More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2930 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2930  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
378 aa  760    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
375 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0687  beta-lactamase domain-containing protein  36.34 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.596111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0867  metallo-beta-lactamase family protein  35.85 
 
 
376 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  34.68 
 
 
376 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0831  metallo-beta-lactamase family protein  35.31 
 
 
376 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00416077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4505  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 
378 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000320753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 
379 aa  235  9e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  34.41 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  34.41 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  34.41 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0673  metallo-beta-lactamase family protein  34.41 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00215478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0871  metallo-beta-lactamase family protein  34.41 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000195083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1152  beta-lactamase domain protein  36.69 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000210846  decreased coverage  0.000000422487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1282  rhodanese-like protein  37.23 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 
397 aa  203  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1187  beta-lactamase domain-containing protein  34.64 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0816  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 
393 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  37.13 
 
 
376 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 
400 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1932  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 
403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 
390 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  32.12 
 
 
397 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3386  beta-lactamase domain protein  30.79 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 
374 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  29.16 
 
 
391 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 
369 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0612  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 
389 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 
369 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.24 
 
 
243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0596  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 
432 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0540  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3165  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 
421 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  41.53 
 
 
244 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.94 
 
 
480 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  29.95 
 
 
370 aa  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 
480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.74 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  35.34 
 
 
472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  35.59 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1429  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  34.02 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 
471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  35.85 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  34.41 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  33.72 
 
 
476 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 
462 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  35.17 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 
464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  31.91 
 
 
244 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
469 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 
476 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  35.08 
 
 
246 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 
470 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  35.08 
 
 
246 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  35.08 
 
 
246 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  35.08 
 
 
246 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  35.08 
 
 
246 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  35.08 
 
 
246 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  34.41 
 
 
243 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  33.57 
 
 
472 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 
243 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 
444 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 
467 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.13 
 
 
502 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 
444 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
466 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  28.17 
 
 
442 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 
463 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  35.6 
 
 
460 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 
484 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 
453 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 
489 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
469 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 
453 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  31.72 
 
 
453 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 
246 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
459 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  38.27 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 
455 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  30.09 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 
488 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 
617 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  36.72 
 
 
470 aa  96.7  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
471 aa  96.7  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 
470 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 
453 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
450 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.58 
 
 
471 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  23.74 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 
243 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.17 
 
 
478 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  26.59 
 
 
442 aa  94  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.63 
 
 
478 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  38.56 
 
 
213 aa  94  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 
471 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>