More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5172 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  67.03 
 
 		 463 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  67.69 
 
 		 470 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 466 aa  963    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  65.79 
 
 		 470 aa  628  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  59.91 
 
 		 471 aa  585  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  62.31 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  57.7 
 
 		 471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  56.86 
 
 		 470 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  57.17 
 
 		 472 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  56.3 
 
 		 471 aa  531  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  51.21 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  41.76 
 
 		 459 aa  346  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  41.76 
 
 		 459 aa  346  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  39.82 
 
 		 459 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  39.82 
 
 		 459 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  39.82 
 
 		 459 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  40.04 
 
 		 459 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  39.44 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  38.74 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  37.69 
 
 		 460 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  38.27 
 
 		 472 aa  295  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  36.36 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 480 aa  279  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  37.77 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.77 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 		 617 aa  269  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  35.67 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  35.56 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  34.58 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  35.19 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 		 471 aa  249  8e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  34.75 
 
 		 480 aa  243  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  33.81 
 
 		 469 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 		 470 aa  236  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.28 
 
 		 478 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  31.15 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.56 
 
 		 478 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.15 
 
 		 478 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.21 
 
 		 478 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  33.88 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  31.97 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  33.41 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 478 aa  226  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  31.92 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  31.66 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 		 484 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.57 
 
 		 456 aa  209  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  31.24 
 
 		 470 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  33.9 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 469 aa  206  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.85 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 450 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.84 
 
 		 502 aa  202  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  32.34 
 
 		 472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 455 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 		 453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  29.6 
 
 		 453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 		 453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 		 476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 		 471 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.18 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  32.44 
 
 		 462 aa  193  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 489 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 		 488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 452 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 		 478 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  29.91 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 452 aa  157  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 466 aa  153  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  38.91 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 244 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  38.94 
 
 		 244 aa  137  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  37.44 
 
 		 251 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  29.28 
 
 		 354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 246 aa  134  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  29.75 
 
 		 346 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 		 243 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 		 243 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.89 
 
 		 243 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.07 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  37.07 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  32.93 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 		 454 aa  119  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  35.47 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>