More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3239 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  490  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  96.3 
 
 		 243 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  93.42 
 
 		 243 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 		 246 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 		 246 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  49.57 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  47.95 
 
 		 243 aa  211  7.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  47.6 
 
 		 488 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  42.5 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  44.54 
 
 		 489 aa  194  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  41.88 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  44.4 
 
 		 457 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  42.29 
 
 		 476 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  38.34 
 
 		 466 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  45.22 
 
 		 462 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  46.28 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  45.65 
 
 		 464 aa  178  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  41.9 
 
 		 479 aa  177  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  37.4 
 
 		 464 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  39.43 
 
 		 464 aa  171  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  39.13 
 
 		 470 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  39.69 
 
 		 480 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 		 469 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.35 
 
 		 480 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 		 471 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 472 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 		 476 aa  161  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 		 484 aa  161  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  38.84 
 
 		 469 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  38.43 
 
 		 470 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  41.81 
 
 		 460 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  43.78 
 
 		 459 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.15 
 
 		 502 aa  158  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  40.26 
 
 		 455 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.91 
 
 		 478 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  40.69 
 
 		 472 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 		 444 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 		 444 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  42.49 
 
 		 461 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 478 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  31.52 
 
 		 478 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.52 
 
 		 478 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.52 
 
 		 478 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.52 
 
 		 478 aa  151  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  31.13 
 
 		 484 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  31.13 
 
 		 484 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  32.81 
 
 		 442 aa  148  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  39.06 
 
 		 459 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 		 459 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 		 459 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  39.06 
 
 		 459 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 		 459 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 		 471 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.6 
 
 		 472 aa  138  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  39.55 
 
 		 459 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  39.55 
 
 		 459 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 463 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 470 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 		 470 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 466 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  38.03 
 
 		 470 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.93 
 
 		 471 aa  125  9e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  36.2 
 
 		 467 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 		 471 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 		 470 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  36.09 
 
 		 453 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  33.05 
 
 		 391 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.75 
 
 		 471 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  32.78 
 
 		 375 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  31.51 
 
 		 442 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 		 382 aa  113  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.94 
 
 		 346 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  35.58 
 
 		 450 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  37.96 
 
 		 379 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 444 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  38.86 
 
 		 451 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  31.44 
 
 		 456 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 617 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 		 450 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  33.92 
 
 		 467 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.41 
 
 		 354 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 		 455 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  34.63 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2930  beta-lactamase domain-containing protein  34.41 
 
 		 378 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  30.74 
 
 		 345 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0673  metallo-beta-lactamase family protein  31.28 
 
 		 376 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00215478  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  27.48 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  27.48 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  29.13 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 378 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  29.13 
 
 		 346 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  31.28 
 
 		 376 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  30.86 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  30.86 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  30.86 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>