More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2681 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  100 
 
 
464 aa  949    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  58.53 
 
 
479 aa  522  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  54.74 
 
 
470 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  53.29 
 
 
480 aa  488  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  54.33 
 
 
480 aa  491  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  53.45 
 
 
469 aa  488  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  54.35 
 
 
472 aa  463  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.68 
 
 
470 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50 
 
 
502 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  46.82 
 
 
469 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 
464 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  46.56 
 
 
466 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
476 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.23 
 
 
478 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  44.23 
 
 
484 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  44.23 
 
 
484 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  46.58 
 
 
471 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.03 
 
 
478 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.03 
 
 
478 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  44.03 
 
 
478 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.84 
 
 
478 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
476 aa  375  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  43.22 
 
 
478 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  45.72 
 
 
484 aa  352  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
444 aa  343  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
444 aa  343  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  37.97 
 
 
442 aa  323  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  39.35 
 
 
461 aa  285  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  37.45 
 
 
459 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  35.74 
 
 
455 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  37.66 
 
 
472 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 
459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  36.29 
 
 
459 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  36.29 
 
 
459 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  36.29 
 
 
459 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 
460 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  35.67 
 
 
459 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  36.42 
 
 
467 aa  260  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  38.51 
 
 
457 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
470 aa  247  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  33.62 
 
 
467 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.42 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  35.31 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 
470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 
471 aa  233  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
463 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
471 aa  229  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.27 
 
 
471 aa  227  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 
466 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
470 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  32.49 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 
489 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
488 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  31.74 
 
 
442 aa  217  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 
453 aa  213  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  35.03 
 
 
464 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 
462 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
470 aa  203  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  31.14 
 
 
448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.85 
 
 
471 aa  192  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 
450 aa  189  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 
455 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 
617 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
480 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  31.24 
 
 
450 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 
470 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  30.94 
 
 
453 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
453 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  39.77 
 
 
243 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  30.15 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.41 
 
 
456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  38.87 
 
 
244 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  39.43 
 
 
243 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 
470 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  39.43 
 
 
243 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.4 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 
471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  31.36 
 
 
446 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  36.29 
 
 
244 aa  159  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  39.15 
 
 
246 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  39.15 
 
 
246 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  39.15 
 
 
246 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  39.15 
 
 
246 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  39.15 
 
 
246 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  39.15 
 
 
246 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  37.4 
 
 
243 aa  156  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 
452 aa  156  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
466 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
476 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
246 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  35.5 
 
 
251 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
454 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 
454 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>