More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3361 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 466 aa  921    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  69.68 
 
 		 470 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  69.83 
 
 		 470 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  55.97 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  56.04 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  52.29 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  51.75 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  51.75 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  51.75 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  51.32 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  51.97 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  50.65 
 
 		 452 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.86 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  50.89 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.06 
 
 		 453 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  46.19 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  35.67 
 
 		 466 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  36.85 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  36.24 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  38.81 
 
 		 446 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 617 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 		 469 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 		 470 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  37.3 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  37.12 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  34.58 
 
 		 484 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34.16 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.79 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  31.69 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.08 
 
 		 478 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.27 
 
 		 480 aa  187  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 		 467 aa  186  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  28.22 
 
 		 478 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.22 
 
 		 478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  28.22 
 
 		 484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  28.22 
 
 		 484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32.33 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 		 459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 		 459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.38 
 
 		 478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.99 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 		 480 aa  183  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 459 aa  183  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.26 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  30.72 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  35.09 
 
 		 479 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  31.26 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 		 470 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  29.19 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  32.74 
 
 		 457 aa  160  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.97 
 
 		 471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.85 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  30.59 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 476 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.52 
 
 		 472 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  34.32 
 
 		 464 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  34 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  30.02 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.16 
 
 		 502 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  26.37 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  25.45 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 		 480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.89 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  35.5 
 
 		 244 aa  108  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  34.74 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.78 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  36.24 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0816  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 		 243 aa  98.2  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  37.61 
 
 		 243 aa  97.1  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 246 aa  97.1  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1282  rhodanese-like protein  32.64 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1187  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1152  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 395 aa  90.9  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000210846  decreased coverage  0.000000422487 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 		 243 aa  90.1  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  32.62 
 
 		 397 aa  86.7  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  39.55 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>