More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1187 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1187  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 393 aa  802    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0816  beta-lactamase domain-containing protein  86.51 
 
 		 393 aa  689    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1152  beta-lactamase domain protein  62.34 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000210846  decreased coverage  0.000000422487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1282  rhodanese-like protein  45.41 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1932  beta-lactamase domain-containing protein  46.02 
 
 		 403 aa  328  8e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0540  beta-lactamase domain protein  43.33 
 
 		 395 aa  295  7e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  38.34 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  36.43 
 
 		 376 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  36.43 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  36.43 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  36.43 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0871  metallo-beta-lactamase family protein  36.43 
 
 		 376 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000195083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0687  beta-lactamase domain-containing protein  36.95 
 
 		 378 aa  239  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.596111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0867  metallo-beta-lactamase family protein  36.76 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  38.4 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0831  metallo-beta-lactamase family protein  36.5 
 
 		 376 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00416077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0673  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00215478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4505  metallo-beta-lactamase family protein  36.43 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000320753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 		 397 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  36.48 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2930  beta-lactamase domain-containing protein  34.64 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3386  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 		 428 aa  196  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  33.42 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 		 376 aa  186  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  34.92 
 
 		 374 aa  186  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0612  beta-lactamase domain protein  33 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  33.42 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 370 aa  163  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  29.22 
 
 		 391 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  33.07 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  29.68 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.63 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.58 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.77 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 		 471 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0596  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 432 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1429  Rhodanese domain protein  27.95 
 
 		 401 aa  99.8  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.86 
 
 		 472 aa  99.4  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  31.43 
 
 		 450 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 		 470 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 444 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  30.64 
 
 		 466 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 471 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3165  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 244 aa  92.8  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  32.56 
 
 		 244 aa  92.8  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.56 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  30.73 
 
 		 251 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  28.46 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 467 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 455 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 466 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  30 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 454 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  30.12 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 617 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.03 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  34.39 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  35.63 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  33.19 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.59 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  27.73 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 		 476 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.29 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  28.4 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  29.79 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.02 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  35.63 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.59 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>