More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2892 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  89.44 
 
 		 478 aa  785    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 452 aa  900    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  58.28 
 
 		 452 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  54.75 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  54.75 
 
 		 453 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  54.75 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  53.67 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  52.9 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  52.55 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  52.02 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  52.78 
 
 		 471 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.34 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  53.48 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  51.07 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  52.3 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.45 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  38.04 
 
 		 451 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  38.2 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.27 
 
 		 480 aa  223  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.08 
 
 		 480 aa  221  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 		 476 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  35.71 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 		 466 aa  213  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 		 459 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 		 459 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35.57 
 
 		 459 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 459 aa  203  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  36.74 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  34.26 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32.65 
 
 		 455 aa  199  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  31.63 
 
 		 472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  35.22 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  33.87 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 467 aa  193  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  32.25 
 
 		 617 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 		 484 aa  189  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  31.12 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 467 aa  188  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 444 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 444 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  33.71 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 		 463 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  33.03 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.77 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  34.24 
 
 		 464 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  30.41 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.93 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.02 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  29.56 
 
 		 484 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  29.05 
 
 		 478 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  29.56 
 
 		 484 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.05 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.49 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.02 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  24.77 
 
 		 448 aa  163  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 462 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  31.92 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  33.79 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 		 450 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 471 aa  160  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 		 471 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  28.37 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.94 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.35 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.51 
 
 		 471 aa  142  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  29.23 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  30.44 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 244 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  29.57 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.38 
 
 		 239 aa  104  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 244 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  35.17 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 		 246 aa  99  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  34.1 
 
 		 251 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.82 
 
 		 243 aa  97.8  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 378 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  34.92 
 
 		 250 aa  97.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  36.1 
 
 		 246 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  36.1 
 
 		 246 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  35.61 
 
 		 246 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>