More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6932 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  67.47 
 
 		 463 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 470 aa  965    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  65.79 
 
 		 466 aa  628  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  61.41 
 
 		 470 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  59.83 
 
 		 471 aa  595  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  58.21 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  57.69 
 
 		 471 aa  568  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  56.87 
 
 		 471 aa  559  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.97 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  51.81 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  53.29 
 
 		 467 aa  485  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  43.91 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  43.91 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  44.25 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  43.26 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  43.26 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  43.26 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  40.76 
 
 		 472 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 		 461 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  40.6 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  38.48 
 
 		 459 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  37.69 
 
 		 455 aa  302  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 		 480 aa  280  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  37.03 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  37.18 
 
 		 456 aa  276  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  35.46 
 
 		 617 aa  276  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  37.08 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 464 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  36.29 
 
 		 471 aa  256  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 		 467 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  33.76 
 
 		 450 aa  246  8e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 		 470 aa  246  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  35.33 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  33.85 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  33.78 
 
 		 469 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.34 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 466 aa  233  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  32.81 
 
 		 448 aa  229  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.36 
 
 		 478 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 478 aa  229  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 		 444 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 		 444 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 		 484 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.27 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  33.95 
 
 		 479 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  34.49 
 
 		 457 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  30.27 
 
 		 478 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.27 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  33.78 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  34.27 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  29.85 
 
 		 484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  29.85 
 
 		 484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 476 aa  219  7.999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.4 
 
 		 478 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 		 455 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  34.1 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 		 470 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  31.76 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  33.12 
 
 		 469 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  31.81 
 
 		 450 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.63 
 
 		 470 aa  202  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 		 471 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.74 
 
 		 502 aa  196  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 476 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.87 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  30.75 
 
 		 488 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 470 aa  177  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  30.27 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 452 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 489 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 470 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  31.28 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  42.56 
 
 		 244 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  37.18 
 
 		 244 aa  139  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  28.54 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  29.1 
 
 		 354 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  37.99 
 
 		 246 aa  132  9e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  37.26 
 
 		 251 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  30.27 
 
 		 346 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  36.7 
 
 		 243 aa  127  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 243 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  33.87 
 
 		 243 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 		 243 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  34.92 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  36.44 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 378 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  35.02 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 		 213 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>