More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3085 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  100 
 
 		 459 aa  929    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  70.58 
 
 		 461 aa  654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  70.64 
 
 		 460 aa  653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  61.79 
 
 		 459 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  60.92 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  60.92 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  60.92 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  60.48 
 
 		 459 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  60.48 
 
 		 459 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  54.95 
 
 		 459 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.87 
 
 		 472 aa  350  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  40.17 
 
 		 471 aa  336  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  39.1 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  41.23 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  39.44 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  40.6 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  39.61 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  39.08 
 
 		 470 aa  309  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 		 480 aa  305  8.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  38.12 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  36.24 
 
 		 471 aa  300  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.65 
 
 		 471 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.18 
 
 		 471 aa  290  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  38.22 
 
 		 476 aa  289  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  35.71 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  35.96 
 
 		 472 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.73 
 
 		 478 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  38.2 
 
 		 444 aa  282  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  34.11 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  34.11 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  34.11 
 
 		 478 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.45 
 
 		 478 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.11 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  37.17 
 
 		 617 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  37.23 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.98 
 
 		 478 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 		 464 aa  266  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  33.12 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  34.5 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  37.45 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  37.2 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  33.12 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  33.12 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 472 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.92 
 
 		 470 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  36.09 
 
 		 484 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  34.41 
 
 		 476 aa  239  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 		 480 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  35.23 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 		 469 aa  233  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  30.24 
 
 		 448 aa  230  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  36.88 
 
 		 457 aa  226  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  30.26 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  37.19 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  34.64 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 453 aa  223  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.25 
 
 		 502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 450 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  32.54 
 
 		 450 aa  216  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  34.89 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  35.1 
 
 		 453 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 		 453 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 		 453 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 		 489 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 		 488 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  34.79 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.54 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  33.03 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 466 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  34.37 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  31.74 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.45 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 		 454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 		 476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 454 aa  156  9e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  41.59 
 
 		 244 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  39.48 
 
 		 243 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 		 243 aa  146  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  39.48 
 
 		 243 aa  143  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.5 
 
 		 243 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  40.29 
 
 		 251 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 		 246 aa  137  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  35.87 
 
 		 244 aa  136  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  38.81 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  38.81 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  38.81 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  38.81 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  38.81 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  38.81 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 		 361 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>