More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3632 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 488 aa  997    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  82.79 
 
 		 489 aa  843    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  37.06 
 
 		 457 aa  266  8e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  37.4 
 
 		 480 aa  259  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  36.88 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 		 469 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 		 480 aa  238  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  35.58 
 
 		 462 aa  229  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  33.6 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  34.29 
 
 		 455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.56 
 
 		 478 aa  223  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.98 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.61 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  29.61 
 
 		 478 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.99 
 
 		 478 aa  220  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  29.77 
 
 		 484 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  29.77 
 
 		 484 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  34.88 
 
 		 479 aa  217  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  32.85 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 		 478 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.54 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34.31 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 		 472 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  32.25 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  47.6 
 
 		 243 aa  200  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  48.47 
 
 		 243 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 470 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  46.72 
 
 		 243 aa  193  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 		 442 aa  193  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.11 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 467 aa  189  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.51 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  42.67 
 
 		 246 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  42.73 
 
 		 246 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  42.73 
 
 		 246 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  42.73 
 
 		 246 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  42.73 
 
 		 246 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  43.61 
 
 		 246 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  43.61 
 
 		 246 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 		 471 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.1 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  40.71 
 
 		 243 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 		 244 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 		 453 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 471 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  28.51 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  38.46 
 
 		 251 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.54 
 
 		 456 aa  156  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  31.65 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 455 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  28.4 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.95 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  29.4 
 
 		 617 aa  147  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.48 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  31.43 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 452 aa  141  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  26.49 
 
 		 448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  29.19 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  34.63 
 
 		 250 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  34.63 
 
 		 250 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  35.71 
 
 		 244 aa  124  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.43 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  32.28 
 
 		 248 aa  120  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  29.41 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  30.72 
 
 		 354 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>