More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3484 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  84.68 
 
 		 245 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  56.22 
 
 		 361 aa  258  8e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  52.05 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  52.16 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  50.22 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  49.79 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  49.79 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  50.22 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  51.5 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  48.29 
 
 		 239 aa  224  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  50.64 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  50.65 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  50.21 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  48.51 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  48.28 
 
 		 250 aa  215  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  47.64 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  48.36 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  49.35 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  48.29 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  49.4 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  48.13 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  46.69 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  46.69 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  45.73 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  46.12 
 
 		 345 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  45.76 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  43.48 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  46.12 
 
 		 344 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  46.19 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.03 
 
 		 357 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  45.26 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  46.78 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  46.35 
 
 		 356 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  46.35 
 
 		 356 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  44.4 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  43.97 
 
 		 346 aa  192  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  42.24 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  44.59 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  44.59 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  44.64 
 
 		 356 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  41.81 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  46.35 
 
 		 356 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  46.35 
 
 		 356 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  45.92 
 
 		 356 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.98 
 
 		 346 aa  148  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  36.87 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2821  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 		 215 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  hitchhiker  0.0000107542 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 		 202 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  35.82 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.31 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  33.58 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 		 294 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  35.29 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 294 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  32.48 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 288 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  35.56 
 
 		 444 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 		 488 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  32.25 
 
 		 289 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  31.54 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  32.48 
 
 		 319 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  32.46 
 
 		 294 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 289 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 		 294 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  31.11 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 		 289 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 288 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 		 489 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  33.93 
 
 		 461 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  38 
 
 		 463 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 		 294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  31.29 
 
 		 294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  30.25 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 315 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.22 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  30.25 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 		 460 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 		 300 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 		 307 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  33.09 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  32.03 
 
 		 307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  31.99 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0946  beta-lactamase-like  28.73 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000101762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>