More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2470 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2535  beta-lactamase-like  69.61 
 
 
312 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  68.08 
 
 
307 aa  430  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  64.94 
 
 
306 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  68.07 
 
 
289 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4665  beta-lactamase domain protein  65.38 
 
 
316 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168284  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  67.47 
 
 
320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  67.37 
 
 
288 aa  404  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  68.31 
 
 
288 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  65.96 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  66.78 
 
 
287 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  64.91 
 
 
288 aa  391  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  67.25 
 
 
288 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0869  beta-lactamase domain-containing protein  61.86 
 
 
293 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.158714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  63.27 
 
 
297 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  66.55 
 
 
288 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  61.56 
 
 
308 aa  384  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  65.97 
 
 
294 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  61.11 
 
 
295 aa  378  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  63.01 
 
 
294 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  65.08 
 
 
294 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  65.08 
 
 
294 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  65.62 
 
 
294 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  64.58 
 
 
289 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  63.07 
 
 
293 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  60.47 
 
 
295 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  60.84 
 
 
294 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  64.58 
 
 
289 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  65.03 
 
 
286 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  61.99 
 
 
294 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  62.37 
 
 
298 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  59.09 
 
 
294 aa  371  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1299  putative metallo-beta-lactamase family protein  63.86 
 
 
286 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  62.67 
 
 
294 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  62.33 
 
 
294 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  64.24 
 
 
294 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  61.67 
 
 
292 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  63.01 
 
 
294 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  59.93 
 
 
297 aa  364  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  58.36 
 
 
307 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  59.86 
 
 
300 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  59.86 
 
 
294 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  61.19 
 
 
286 aa  360  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6795  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  60.84 
 
 
297 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  60.42 
 
 
293 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  60.63 
 
 
294 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  62.59 
 
 
297 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  60 
 
 
286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2816  beta-lactamase-like  58.6 
 
 
293 aa  352  4e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104753  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  60.27 
 
 
319 aa  351  7e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  59.86 
 
 
298 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  58.95 
 
 
296 aa  349  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  58.54 
 
 
289 aa  348  9e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1544  hypothetical protein  61.13 
 
 
286 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1705  beta-lactamase domain protein  60.56 
 
 
286 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.739327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  59.58 
 
 
299 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  55.79 
 
 
290 aa  343  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2013  beta-lactamase domain protein  60.21 
 
 
286 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439251  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  58.89 
 
 
308 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3460  Beta-lactamase-like  59.15 
 
 
287 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3688  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  58.89 
 
 
295 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  54.9 
 
 
306 aa  337  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  60 
 
 
298 aa  336  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  56.75 
 
 
300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  56.75 
 
 
300 aa  328  6e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  54.55 
 
 
296 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  56.64 
 
 
299 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  52.58 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  58.42 
 
 
308 aa  318  9e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  54.42 
 
 
303 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3366  beta-lactamase-like  54.03 
 
 
316 aa  315  8e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  51.93 
 
 
289 aa  315  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  54.42 
 
 
303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  55.75 
 
 
296 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  54.55 
 
 
432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  51.39 
 
 
290 aa  310  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  54.36 
 
 
303 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.2 
 
 
439 aa  309  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  52.11 
 
 
287 aa  309  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  52.82 
 
 
307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  52.2 
 
 
431 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  50.69 
 
 
290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  55.48 
 
 
426 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  51.93 
 
 
302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  55.09 
 
 
310 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  51.57 
 
 
301 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  52.26 
 
 
307 aa  297  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  52.78 
 
 
426 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3205  beta-lactamase domain-containing protein  56.9 
 
 
290 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568485  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  52.43 
 
 
297 aa  291  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  52.43 
 
 
297 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  50.34 
 
 
304 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2168  beta-lactamase-like protein  53.33 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583508  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  51.94 
 
 
297 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  46.83 
 
 
290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1647  beta-lactamase domain protein  45.99 
 
 
289 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0946  beta-lactamase-like  46.07 
 
 
288 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000101762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  51.89 
 
 
266 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1978  beta-lactamase domain-containing protein  45.3 
 
 
288 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  43.66 
 
 
284 aa  248  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>