More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2511 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  67.87 
 
 		 249 aa  359  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  67.87 
 
 		 249 aa  358  6e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  62.25 
 
 		 249 aa  335  5.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  62.96 
 
 		 244 aa  322  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  54.94 
 
 		 250 aa  301  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  59.84 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  59.84 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  54.29 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  58.68 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  52.65 
 
 		 250 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  55.51 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  52.89 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  51.5 
 
 		 361 aa  236  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  51.54 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  51.54 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  53.51 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  52.42 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  52.42 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  46.38 
 
 		 345 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  50 
 
 		 258 aa  224  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  48.23 
 
 		 229 aa  218  7e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  51.1 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  47.21 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  48.67 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  48.67 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  43.83 
 
 		 346 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  47.64 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  48.29 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  46.64 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  50 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  42.98 
 
 		 346 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  47.79 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  47.79 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 		 356 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 356 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  46.9 
 
 		 344 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  49.14 
 
 		 356 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  49.34 
 
 		 230 aa  209  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  47.56 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  46.58 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.13 
 
 		 357 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  42.67 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  50.22 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  42.24 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  61.48 
 
 		 186 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  40.71 
 
 		 346 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  38.21 
 
 		 354 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 		 301 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  29.96 
 
 		 294 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 206 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  29.15 
 
 		 288 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  29.24 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.22 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01826  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00340)  29.82 
 
 		 407 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362408 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1647  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  30.68 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.19 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  29.21 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 484 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2816  beta-lactamase-like  29.06 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104753  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  29.48 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.5 
 
 		 211 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1071  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0956  metallo-beta-lactamase family protein  33.65 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  29.21 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 210 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  26.3 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.06 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 		 452 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.55 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  27.99 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 		 478 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.86 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  28.41 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  27.99 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>