More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1411 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 300 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  99.67 
 
 		 300 aa  610  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  63.82 
 
 		 293 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  64.06 
 
 		 286 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  63.44 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  61.59 
 
 		 297 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1705  beta-lactamase domain protein  62.19 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.739327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1299  putative metallo-beta-lactamase family protein  60.78 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2013  beta-lactamase domain protein  61.48 
 
 		 286 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1544  hypothetical protein  61.48 
 
 		 286 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  59.64 
 
 		 286 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  58.01 
 
 		 286 aa  362  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3460  Beta-lactamase-like  59.22 
 
 		 287 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  57.48 
 
 		 298 aa  351  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  57.09 
 
 		 296 aa  348  8e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  53.9 
 
 		 306 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  58.33 
 
 		 292 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  56.06 
 
 		 294 aa  344  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  56.4 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  60.14 
 
 		 308 aa  342  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  57 
 
 		 319 aa  342  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  56.89 
 
 		 306 aa  342  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  58.36 
 
 		 288 aa  340  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  56.4 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  51.43 
 
 		 290 aa  339  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  56.8 
 
 		 294 aa  338  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  56.6 
 
 		 289 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  57.34 
 
 		 293 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  57.6 
 
 		 288 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  57.5 
 
 		 288 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2535  beta-lactamase-like  57.6 
 
 		 312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  56.74 
 
 		 289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  56.94 
 
 		 289 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  57.24 
 
 		 288 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  56.19 
 
 		 308 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  56.9 
 
 		 294 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  55.71 
 
 		 294 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  55.02 
 
 		 294 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  53.38 
 
 		 300 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  55.94 
 
 		 287 aa  330  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  53.38 
 
 		 307 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  53.87 
 
 		 297 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  55.12 
 
 		 297 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  55.7 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  58.01 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  55.28 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  56.4 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  56.4 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  53.74 
 
 		 294 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  56.18 
 
 		 288 aa  329  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  56.75 
 
 		 315 aa  328  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  54.45 
 
 		 295 aa  328  7e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  56.06 
 
 		 294 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  55.52 
 
 		 299 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  52.46 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  55.02 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  51.58 
 
 		 289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  53.15 
 
 		 290 aa  326  3e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  55.83 
 
 		 308 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  52.43 
 
 		 290 aa  324  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  53.66 
 
 		 288 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  55.48 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  53.17 
 
 		 289 aa  318  5e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0869  beta-lactamase domain-containing protein  52.13 
 
 		 293 aa  318  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4665  beta-lactamase domain protein  55.87 
 
 		 316 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168284  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  50.34 
 
 		 295 aa  315  5e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  55.09 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6795  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  54.96 
 
 		 297 aa  308  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  51.24 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  49.83 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  50 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2816  beta-lactamase-like  51.58 
 
 		 293 aa  301  9e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104753  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3688  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  52.86 
 
 		 295 aa  298  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  51.24 
 
 		 303 aa  298  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  50.18 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3205  beta-lactamase domain-containing protein  53.63 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  48.6 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  49.65 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  50 
 
 		 432 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  48.21 
 
 		 302 aa  291  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  48.28 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  46.81 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2168  beta-lactamase-like protein  51.06 
 
 		 284 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3366  beta-lactamase-like  48.41 
 
 		 316 aa  285  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.43 
 
 		 439 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  49.65 
 
 		 304 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  49.13 
 
 		 297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  49.13 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  48.78 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  47.9 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  46.83 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  46.45 
 
 		 426 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  45.39 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  45.04 
 
 		 290 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0946  beta-lactamase-like  44.68 
 
 		 288 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000101762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  47.35 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  50.19 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1647  beta-lactamase domain protein  45.07 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02317  beta-lactamase  50.38 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.914825  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3513  hypothetical protein  42.5 
 
 		 305 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106163  normal  0.808023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>