More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0890 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  100 
 
 		 295 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  87.12 
 
 		 295 aa  549  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3688  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  76.27 
 
 		 295 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6795  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  73.38 
 
 		 297 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  67.35 
 
 		 294 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  68.97 
 
 		 297 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  66.21 
 
 		 294 aa  421  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2816  beta-lactamase-like  64.07 
 
 		 293 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104753  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0869  beta-lactamase domain-containing protein  60.84 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  62.89 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  64.34 
 
 		 288 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  63.51 
 
 		 288 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  63.73 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  61.11 
 
 		 315 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  60.92 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  61.54 
 
 		 307 aa  371  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  60.92 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2535  beta-lactamase-like  59.93 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  61.67 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4665  beta-lactamase domain protein  60.84 
 
 		 316 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168284  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  58.8 
 
 		 293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  57.49 
 
 		 308 aa  361  9e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  56.79 
 
 		 286 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  58.95 
 
 		 287 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  57.04 
 
 		 294 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  58.8 
 
 		 288 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  58.19 
 
 		 286 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  57.39 
 
 		 289 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  57.39 
 
 		 294 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  57.39 
 
 		 289 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  57.39 
 
 		 294 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  57.39 
 
 		 294 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  57.39 
 
 		 294 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  57.79 
 
 		 297 aa  352  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  56.29 
 
 		 288 aa  351  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  55.29 
 
 		 297 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  56.85 
 
 		 319 aa  350  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  56.29 
 
 		 289 aa  351  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  57.88 
 
 		 294 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  56.9 
 
 		 294 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  55.86 
 
 		 300 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  55.86 
 
 		 307 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  55.59 
 
 		 288 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  55.86 
 
 		 294 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  56.29 
 
 		 296 aa  344  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  56.69 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  57.24 
 
 		 293 aa  342  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  55.59 
 
 		 286 aa  342  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  56.34 
 
 		 294 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  54.17 
 
 		 289 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  55.56 
 
 		 294 aa  341  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  56.34 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  51.38 
 
 		 306 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1544  hypothetical protein  56.43 
 
 		 286 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  54.45 
 
 		 300 aa  328  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  54.45 
 
 		 300 aa  328  7e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.29 
 
 		 299 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1299  putative metallo-beta-lactamase family protein  53.31 
 
 		 286 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1705  beta-lactamase domain protein  54.64 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.739327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  54.61 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  54.42 
 
 		 298 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  48.8 
 
 		 290 aa  318  5e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  51.6 
 
 		 289 aa  318  7e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2013  beta-lactamase domain protein  53.93 
 
 		 286 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  53.82 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  50.53 
 
 		 431 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  49.65 
 
 		 432 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  52.82 
 
 		 298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  50.18 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  49.83 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3460  Beta-lactamase-like  51.25 
 
 		 287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  50.7 
 
 		 307 aa  305  7e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  49.66 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  49.65 
 
 		 303 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  49.3 
 
 		 303 aa  298  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  49.3 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  47.26 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  49.65 
 
 		 290 aa  295  8e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.6 
 
 		 439 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  49.12 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3366  beta-lactamase-like  47.72 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  49.12 
 
 		 426 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  49.83 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  48.96 
 
 		 295 aa  289  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3205  beta-lactamase domain-containing protein  53.5 
 
 		 290 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  48.76 
 
 		 426 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  48.07 
 
 		 297 aa  288  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  48.07 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  48.61 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  47.2 
 
 		 302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  45.8 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  48.95 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  44.72 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  45.68 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2168  beta-lactamase-like protein  47.55 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0946  beta-lactamase-like  43.77 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000101762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1647  beta-lactamase domain protein  43.4 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  45 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02317  beta-lactamase  49.81 
 
 		 270 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.914825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  47.55 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>