More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0869 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0869  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
293 aa  610  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.158714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  62.63 
 
 
295 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  60.84 
 
 
295 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  62.11 
 
 
294 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  61.54 
 
 
294 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  62.46 
 
 
297 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  61.86 
 
 
315 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  62.5 
 
 
288 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  61.4 
 
 
288 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2816  beta-lactamase-like  59.38 
 
 
293 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104753  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6795  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  61.46 
 
 
297 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  62.19 
 
 
288 aa  377  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3688  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  62.59 
 
 
295 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  58.33 
 
 
288 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  57.64 
 
 
288 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  58.66 
 
 
306 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  57.49 
 
 
298 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  57.6 
 
 
307 aa  363  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2535  beta-lactamase-like  56.99 
 
 
312 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  57.6 
 
 
287 aa  360  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  56.99 
 
 
293 aa  358  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  56.64 
 
 
308 aa  358  7e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  55.48 
 
 
292 aa  355  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  56.69 
 
 
288 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4665  beta-lactamase domain protein  57.39 
 
 
316 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168284  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  56.21 
 
 
319 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  56.16 
 
 
289 aa  346  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  55.17 
 
 
294 aa  345  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  56.18 
 
 
286 aa  345  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1299  putative metallo-beta-lactamase family protein  56.34 
 
 
286 aa  344  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  55.24 
 
 
294 aa  344  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  53.82 
 
 
306 aa  343  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1544  hypothetical protein  55.67 
 
 
286 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  54.9 
 
 
289 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  55.48 
 
 
320 aa  341  7e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  55.59 
 
 
294 aa  341  8e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  55.59 
 
 
294 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  55.09 
 
 
286 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  55.24 
 
 
294 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  55.99 
 
 
294 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  54.9 
 
 
294 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  54.05 
 
 
294 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1705  beta-lactamase domain protein  54.96 
 
 
286 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.739327 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  54.9 
 
 
294 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  54.2 
 
 
289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  51.86 
 
 
297 aa  338  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  56.34 
 
 
286 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  52.4 
 
 
307 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  53.52 
 
 
290 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  55.32 
 
 
293 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.79 
 
 
294 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  55.36 
 
 
294 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  52.4 
 
 
300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  52.4 
 
 
294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  53.85 
 
 
297 aa  334  7.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2013  beta-lactamase domain protein  54.26 
 
 
286 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439251  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  54.26 
 
 
287 aa  332  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  53.12 
 
 
308 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  53.1 
 
 
299 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  53.5 
 
 
289 aa  329  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  53.74 
 
 
289 aa  329  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  54.58 
 
 
296 aa  328  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3460  Beta-lactamase-like  53.19 
 
 
287 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  53.93 
 
 
299 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  51.04 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3366  beta-lactamase-like  51.41 
 
 
316 aa  318  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  52.13 
 
 
300 aa  318  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  52.13 
 
 
300 aa  318  6e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  50.7 
 
 
301 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  52.45 
 
 
307 aa  315  7e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  52.45 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  49.83 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  52.1 
 
 
432 aa  311  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  50.7 
 
 
298 aa  308  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  48.79 
 
 
303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  49.12 
 
 
303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  48.44 
 
 
295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  50.18 
 
 
310 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  48.45 
 
 
303 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  52.13 
 
 
308 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  48.79 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  49.15 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  49.15 
 
 
297 aa  298  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50 
 
 
439 aa  298  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  48.26 
 
 
431 aa  297  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  49.82 
 
 
426 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  48.81 
 
 
297 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0946  beta-lactamase-like  48.75 
 
 
288 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000101762  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3205  beta-lactamase domain-containing protein  51.4 
 
 
290 aa  288  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568485  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  48.58 
 
 
426 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.89 
 
 
290 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  46.85 
 
 
290 aa  282  6.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  45.14 
 
 
290 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  47.72 
 
 
304 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  46.81 
 
 
297 aa  275  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  46.1 
 
 
284 aa  262  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1647  beta-lactamase domain protein  45.14 
 
 
289 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2168  beta-lactamase-like protein  47.33 
 
 
284 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583508  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1978  beta-lactamase domain-containing protein  45.83 
 
 
288 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02317  beta-lactamase  49.23 
 
 
270 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.914825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>