More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2239 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  594  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  98.61 
 
 
288 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  71.99 
 
 
288 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  67.97 
 
 
287 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  67.48 
 
 
288 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  64.24 
 
 
288 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2535  beta-lactamase-like  64.79 
 
 
312 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  60.76 
 
 
288 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  66.55 
 
 
315 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3460  Beta-lactamase-like  65.6 
 
 
287 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  63.25 
 
 
289 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  64.91 
 
 
286 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  62.94 
 
 
298 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  64.56 
 
 
294 aa  374  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  61.92 
 
 
306 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  62.81 
 
 
294 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4665  beta-lactamase domain protein  63.25 
 
 
316 aa  371  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168284  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  61.75 
 
 
307 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  62.81 
 
 
294 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  61.13 
 
 
320 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  62.11 
 
 
294 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  61.54 
 
 
308 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  64.21 
 
 
294 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0869  beta-lactamase domain-containing protein  57.64 
 
 
293 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.158714 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  64.21 
 
 
294 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1544  hypothetical protein  63.35 
 
 
286 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  63.16 
 
 
289 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  63.51 
 
 
294 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  59.23 
 
 
286 aa  364  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  63.16 
 
 
289 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  63.51 
 
 
294 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  57.89 
 
 
296 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  61.59 
 
 
319 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  61.05 
 
 
293 aa  362  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  59.79 
 
 
289 aa  362  4e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  60.7 
 
 
292 aa  362  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  60.7 
 
 
297 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  61.75 
 
 
294 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  60.14 
 
 
293 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2013  beta-lactamase domain protein  62.28 
 
 
286 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439251  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1705  beta-lactamase domain protein  61.92 
 
 
286 aa  353  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.739327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1299  putative metallo-beta-lactamase family protein  59.23 
 
 
286 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  60.48 
 
 
300 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  60.48 
 
 
307 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  60.48 
 
 
294 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  60.21 
 
 
297 aa  352  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  59.52 
 
 
297 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  56.64 
 
 
295 aa  350  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  57.64 
 
 
286 aa  349  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  60.63 
 
 
294 aa  348  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2816  beta-lactamase-like  58.1 
 
 
293 aa  348  6e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104753  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  55.59 
 
 
295 aa  347  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  60.42 
 
 
294 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  52.98 
 
 
306 aa  342  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  55.44 
 
 
294 aa  341  7e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  51.93 
 
 
290 aa  341  7e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6795  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  57.89 
 
 
297 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  57.6 
 
 
300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  57.6 
 
 
300 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  54.74 
 
 
294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  56.94 
 
 
299 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  56.34 
 
 
299 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  56.18 
 
 
298 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3688  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  55.9 
 
 
295 aa  325  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  56.34 
 
 
308 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  55.99 
 
 
298 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  51.59 
 
 
287 aa  323  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  51.25 
 
 
289 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  57.24 
 
 
308 aa  317  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  53.52 
 
 
303 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  49.82 
 
 
302 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  52.11 
 
 
432 aa  308  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  50.35 
 
 
301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  52.45 
 
 
307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  51.05 
 
 
439 aa  305  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  51.41 
 
 
307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  48.29 
 
 
295 aa  305  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  52.46 
 
 
303 aa  305  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  50.88 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  52.46 
 
 
303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  50.53 
 
 
431 aa  302  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  49.47 
 
 
296 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  51.77 
 
 
426 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3205  beta-lactamase domain-containing protein  57.04 
 
 
290 aa  298  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568485  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  48.96 
 
 
290 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  50.35 
 
 
296 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3366  beta-lactamase-like  50.53 
 
 
316 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  47.04 
 
 
290 aa  295  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  50.35 
 
 
297 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.34 
 
 
290 aa  292  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1647  beta-lactamase domain protein  45.49 
 
 
289 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  50.18 
 
 
426 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2168  beta-lactamase-like protein  52.46 
 
 
284 aa  284  9e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583508  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  49.12 
 
 
297 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  48.76 
 
 
297 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1978  beta-lactamase domain-containing protein  45.8 
 
 
288 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  52.27 
 
 
266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02317  beta-lactamase  54.41 
 
 
270 aa  269  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.914825  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  44.33 
 
 
284 aa  258  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>