More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1960 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 250 aa  517  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  73.2 
 
 		 250 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  60 
 
 		 250 aa  323  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  61.97 
 
 		 250 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  55.6 
 
 		 250 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  55.6 
 
 		 250 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  57.32 
 
 		 244 aa  299  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  56.15 
 
 		 249 aa  292  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  55.92 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  55.1 
 
 		 249 aa  287  9e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  52.65 
 
 		 249 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  51.72 
 
 		 242 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  51.08 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  51.08 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  49.13 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  48.05 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  50 
 
 		 258 aa  218  8.999999999999998e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  46.52 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  48.91 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  49.37 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  44.13 
 
 		 357 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  49.13 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  49.13 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  46.09 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  44.12 
 
 		 356 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  45.22 
 
 		 229 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  45.49 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  46.32 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  44.16 
 
 		 356 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  43.7 
 
 		 356 aa  204  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  45.73 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  43.33 
 
 		 356 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  44.62 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  42.8 
 
 		 344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  46.09 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  41 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  39.45 
 
 		 346 aa  196  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  44.59 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  44.16 
 
 		 356 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  44.16 
 
 		 356 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  45.22 
 
 		 229 aa  195  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  38.67 
 
 		 346 aa  191  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.08 
 
 		 357 aa  191  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  40.43 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  40.43 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  55.4 
 
 		 186 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.96 
 
 		 346 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  35.22 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 297 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 202 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  29.68 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  30.18 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  31.27 
 
 		 294 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.88 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  31.11 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  35.98 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  29.54 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  29.79 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  29.82 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.04 
 
 		 292 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  30.1 
 
 		 307 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  29.5 
 
 		 298 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 		 289 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3366  beta-lactamase-like  30.11 
 
 		 316 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  29.27 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  29.8 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  30.86 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  29.8 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  27.84 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.45 
 
 		 299 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2168  beta-lactamase-like protein  30.86 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583508  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 		 476 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.61 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>