More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2295 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  58.95 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  57.64 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  56.33 
 
 		 345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  55.9 
 
 		 346 aa  272  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  53.85 
 
 		 233 aa  244  6e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  53.85 
 
 		 233 aa  244  6e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  51.95 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  51.95 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  51.5 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  51.72 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  50.66 
 
 		 242 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  52.36 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  50.66 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  50.22 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  46.52 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  46.72 
 
 		 232 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  44.78 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  48.7 
 
 		 361 aa  209  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  46.58 
 
 		 249 aa  207  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  44.74 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  45.89 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  46.12 
 
 		 229 aa  204  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  42.06 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  42.06 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  46.61 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  46.19 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 357 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  42.42 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  43.48 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.73 
 
 		 357 aa  191  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  44.35 
 
 		 249 aa  191  9e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  43.35 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 		 356 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  44.78 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 		 356 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  42.74 
 
 		 356 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  44.16 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  43.04 
 
 		 244 aa  185  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 		 356 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  42.67 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  43.48 
 
 		 356 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 		 356 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  43.48 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  43.53 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  42.73 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.18 
 
 		 346 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  35.65 
 
 		 354 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  31.95 
 
 		 432 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  34.02 
 
 		 462 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  31.85 
 
 		 302 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 303 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 		 307 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  34.43 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 294 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  32.04 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3366  beta-lactamase-like  32.08 
 
 		 316 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  32.04 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 289 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  29.48 
 
 		 290 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  27.99 
 
 		 426 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  29.17 
 
 		 431 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  28.95 
 
 		 426 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.11 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  28.89 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  28.25 
 
 		 297 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  30.67 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 297 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 310 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  34.97 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 202 aa  105  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  29.37 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  33.95 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 484 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 464 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3460  Beta-lactamase-like  28.62 
 
 		 287 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.71 
 
 		 299 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.16 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  29.51 
 
 		 457 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.95 
 
 		 293 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>