More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2270 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  64.4 
 
 		 250 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  57.6 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  55.6 
 
 		 250 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  56 
 
 		 250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  59.84 
 
 		 249 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  59.76 
 
 		 244 aa  301  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  59.84 
 
 		 249 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  58.2 
 
 		 249 aa  292  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  58.61 
 
 		 249 aa  292  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  55.46 
 
 		 242 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  51.3 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  51.3 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  52.4 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  52.4 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  49.78 
 
 		 233 aa  228  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  53.33 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  48.94 
 
 		 232 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  49.15 
 
 		 361 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  48.7 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  48.7 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  48.94 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  48.03 
 
 		 230 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  46.75 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  46.69 
 
 		 248 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  49.57 
 
 		 356 aa  204  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  48.47 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  49.57 
 
 		 356 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  49.13 
 
 		 356 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  49.13 
 
 		 356 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  45.53 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.23 
 
 		 357 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  45.41 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  40.62 
 
 		 346 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  43.48 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  44.26 
 
 		 344 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  41.35 
 
 		 346 aa  194  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  42.61 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  49.13 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  49.13 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  49.13 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  46.02 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  43.04 
 
 		 233 aa  188  9e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  43.04 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  62.59 
 
 		 186 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  37.87 
 
 		 235 aa  178  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  37.87 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  39.57 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  36.05 
 
 		 354 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  34.63 
 
 		 488 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 		 489 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.41 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.6 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  31.85 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  31.72 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  32.2 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  29.82 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 		 464 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 		 294 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 		 300 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 		 294 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  31.62 
 
 		 288 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 		 289 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  33.45 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  31.69 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  29.37 
 
 		 432 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.58 
 
 		 439 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  31.25 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  31 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 484 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  29.47 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  33.18 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1299  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.43 
 
 		 286 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.6 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.73 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.57 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.85 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>