More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0932 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 229 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  52.19 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  50.87 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  50.87 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  50.22 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  49.34 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  48.68 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  48.68 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  46.93 
 
 		 357 aa  224  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  50.66 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  45.58 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  49.56 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  48.23 
 
 		 249 aa  218  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  49.13 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  47.79 
 
 		 344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  44.74 
 
 		 356 aa  215  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 		 356 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 		 356 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  46.02 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 		 356 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  46.7 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  46.46 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  45.89 
 
 		 250 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  46.02 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  44.16 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.3 
 
 		 357 aa  208  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  44.69 
 
 		 345 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  44.35 
 
 		 250 aa  207  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  45.22 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  46.02 
 
 		 244 aa  205  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  46.12 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  46.02 
 
 		 346 aa  204  9e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  43.91 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  45.58 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  46.7 
 
 		 361 aa  202  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  44.69 
 
 		 346 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  44.74 
 
 		 356 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 		 356 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  43.48 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  46.67 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  43.36 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  43.36 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  42.61 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  42.61 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  39.38 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  38.94 
 
 		 235 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  35.07 
 
 		 287 aa  148  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.32 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  39.15 
 
 		 346 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  35.34 
 
 		 288 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  32.84 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  33.21 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  35.71 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.7 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4665  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168284  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  33.58 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  31.48 
 
 		 294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  32.96 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  31.27 
 
 		 319 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.49 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  32.71 
 
 		 295 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2535  beta-lactamase-like  33.46 
 
 		 312 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  34.31 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  32.47 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  32.36 
 
 		 295 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1544  hypothetical protein  32.3 
 
 		 286 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  38.16 
 
 		 308 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 289 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  31.58 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  32.1 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  34.39 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 286 aa  121  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 308 aa  121  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  31.2 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1705  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 		 286 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.739327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  31.43 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  31.77 
 
 		 300 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.09 
 
 		 299 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  31.77 
 
 		 307 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1647  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  31.77 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>