More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2688 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 250 aa  517  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  73.2 
 
 		 250 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  62.8 
 
 		 250 aa  337  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  58.55 
 
 		 250 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  57.6 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  57.6 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  59.68 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  58.78 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  54.94 
 
 		 249 aa  301  9e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  56.4 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  56.22 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  48.5 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  48.5 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  48.48 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  47.83 
 
 		 242 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  50.64 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  47.39 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  47.41 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  47.37 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  48.28 
 
 		 248 aa  215  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  44.78 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  44.07 
 
 		 344 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  44.16 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  44.96 
 
 		 356 aa  207  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  46.84 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  45.38 
 
 		 357 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  44.54 
 
 		 356 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  44.78 
 
 		 356 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  45.65 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  44.54 
 
 		 356 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  45.65 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  41.84 
 
 		 345 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  45.89 
 
 		 361 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  40.17 
 
 		 346 aa  198  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  45.61 
 
 		 239 aa  198  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  43.48 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.61 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  44.78 
 
 		 356 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  45.02 
 
 		 229 aa  193  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  38.49 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  44.78 
 
 		 356 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  44.78 
 
 		 356 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  41.3 
 
 		 233 aa  185  8e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  41.3 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  38.7 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  38.7 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  60.43 
 
 		 186 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.1 
 
 		 346 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  34.56 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  31.25 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.62 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  31.29 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.62 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 294 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 289 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 488 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  39.11 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  34.32 
 
 		 289 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 295 aa  111  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 489 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  30.22 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  32.09 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  30.4 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  32.34 
 
 		 294 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  30.22 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  28.94 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  31.34 
 
 		 294 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 289 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  32.34 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  30.18 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 471 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 484 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  30.86 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  34.21 
 
 		 476 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  31.51 
 
 		 479 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  29.52 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  29.39 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 459 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 459 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>