More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3773 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 354 aa  731    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  59.24 
 
 		 346 aa  437  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  35.59 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  34.86 
 
 		 346 aa  199  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  34.57 
 
 		 346 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  43.48 
 
 		 235 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  43.48 
 
 		 235 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  34.1 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 		 344 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  33.06 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 		 356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  41.23 
 
 		 233 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  41.23 
 
 		 233 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  33.24 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  41.85 
 
 		 239 aa  169  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  32.68 
 
 		 356 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 		 356 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  39.82 
 
 		 232 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  37.61 
 
 		 228 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  36 
 
 		 229 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  36 
 
 		 229 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 357 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  36.87 
 
 		 248 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 		 242 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  36.79 
 
 		 249 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.65 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 		 249 aa  146  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 		 246 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 202 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  36.36 
 
 		 258 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  36.05 
 
 		 250 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.21 
 
 		 239 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  36.05 
 
 		 250 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  29.68 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  35.81 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 		 230 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.36 
 
 		 230 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  36.09 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  35.65 
 
 		 233 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  35.4 
 
 		 249 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  36.49 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 		 244 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  33.49 
 
 		 230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 250 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.43 
 
 		 243 aa  126  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  33.63 
 
 		 233 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  33.49 
 
 		 229 aa  126  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  31.56 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  37.16 
 
 		 232 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.99 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.82 
 
 		 211 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 		 250 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 476 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 		 453 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.92 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  32.38 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 		 471 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 470 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  33.48 
 
 		 250 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 		 220 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 		 488 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 489 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  32.67 
 
 		 218 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.75 
 
 		 213 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 213 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 469 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 		 617 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  32.12 
 
 		 450 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 214 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.07 
 
 		 471 aa  113  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 206 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  33.84 
 
 		 207 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 		 205 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 466 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 205 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.26 
 
 		 201 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 463 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 		 444 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 		 444 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 226 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>