More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0691 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
345 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  83.38 
 
 
346 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  81.92 
 
 
346 aa  599  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  74.64 
 
 
344 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  58.67 
 
 
233 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  58.67 
 
 
233 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  56.33 
 
 
233 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  50.65 
 
 
235 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  50.22 
 
 
235 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  40.17 
 
 
361 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  42.42 
 
 
356 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  42.98 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  41.85 
 
 
356 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  42.42 
 
 
356 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  42.66 
 
 
356 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  50 
 
 
232 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  42.98 
 
 
356 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  42.98 
 
 
356 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  48.23 
 
 
230 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  48.23 
 
 
230 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  46.38 
 
 
249 aa  226  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  49.12 
 
 
233 aa  222  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 
357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  48.46 
 
 
242 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  48.23 
 
 
230 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  50.88 
 
 
232 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  49.78 
 
 
229 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  49.78 
 
 
229 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.17 
 
 
357 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  45.26 
 
 
249 aa  210  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  44.69 
 
 
229 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  48.21 
 
 
239 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  46.38 
 
 
250 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  43.67 
 
 
249 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  47.23 
 
 
258 aa  206  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  43.04 
 
 
250 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  44.81 
 
 
245 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  42.98 
 
 
244 aa  202  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  41.84 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.38 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  46.12 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  45.41 
 
 
250 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  45.41 
 
 
250 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  41 
 
 
250 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.1 
 
 
354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  44.44 
 
 
228 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  43.86 
 
 
249 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  47.79 
 
 
239 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  44.44 
 
 
229 aa  185  9e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 
467 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
297 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 
244 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.03 
 
 
471 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 
466 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 
462 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 
266 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.02 
 
 
472 aa  113  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 
489 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 
463 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 
459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 
470 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 
476 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  31.65 
 
 
288 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
220 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 
214 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32.51 
 
 
455 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.6 
 
 
243 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
288 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3354  aminotransferase, class V  28.49 
 
 
759 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.53 
 
 
218 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 
300 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 
300 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 
290 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 
464 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  30.8 
 
 
288 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 
471 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  30.8 
 
 
288 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 
243 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 
298 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
236 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  30.73 
 
 
237 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  29.12 
 
 
302 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 
471 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  31.72 
 
 
287 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 
304 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  30.23 
 
 
459 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 
213 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 
484 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  29.89 
 
 
286 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 
288 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  28.79 
 
 
290 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  44.53 
 
 
134 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  27.89 
 
 
771 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  38.78 
 
 
213 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>