More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3667 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  92.46 
 
 		 346 aa  666    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  100 
 
 		 346 aa  707    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  83.38 
 
 		 345 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  72.3 
 
 		 344 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  59.56 
 
 		 233 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  59.56 
 
 		 233 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  55.9 
 
 		 233 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  51.52 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  51.52 
 
 		 235 aa  255  8e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  40.72 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  40.38 
 
 		 356 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  40.61 
 
 		 356 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  41.19 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 356 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  49.12 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  47.35 
 
 		 230 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  47.35 
 
 		 230 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  40.92 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  48.02 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  40.11 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  40.11 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  48.03 
 
 		 242 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  42.98 
 
 		 249 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  48.94 
 
 		 258 aa  210  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  48.67 
 
 		 232 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.82 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.72 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  47.79 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  46.52 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  43.53 
 
 		 249 aa  205  8e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  47.11 
 
 		 229 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  47.11 
 
 		 229 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  44.4 
 
 		 245 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  44.69 
 
 		 229 aa  202  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  42.55 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  45.09 
 
 		 239 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.57 
 
 		 354 aa  199  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  40.17 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  40.62 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  40.62 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  44.4 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  38.49 
 
 		 250 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 		 244 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  47.35 
 
 		 239 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  43.56 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  37.35 
 
 		 249 aa  180  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  44 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 246 aa  139  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 467 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  33.06 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.91 
 
 		 471 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  32.1 
 
 		 462 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 		 266 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  33.62 
 
 		 390 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 		 202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.37 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 		 459 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 		 489 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 466 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.74 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32.47 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 476 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  29.89 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  31.42 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 		 461 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  30.8 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 220 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  29.5 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  28.08 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 		 214 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 		 463 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  34.3 
 
 		 237 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  37.65 
 
 		 213 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  30.92 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  29.12 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 		 205 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  34.44 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  28.36 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  26.67 
 
 		 778 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>