More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2264 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  76.6 
 
 		 237 aa  381  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  66.67 
 
 		 237 aa  322  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  68.09 
 
 		 236 aa  320  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  64.1 
 
 		 238 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  64.1 
 
 		 238 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  64.1 
 
 		 238 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  64.1 
 
 		 262 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  63.68 
 
 		 238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  40.11 
 
 		 237 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.2 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.56 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  29.67 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  34.33 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  29.67 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.18 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3108  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.06 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  34.12 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 		 210 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  35.18 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  35.87 
 
 		 361 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.63 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  32.23 
 
 		 346 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  33.69 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.64 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  33.16 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  33.94 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  38.78 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  33.18 
 
 		 345 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  34.09 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  31.39 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  31.43 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.19 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  32.48 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  31.75 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  33.87 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.01 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  35.55 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 		 344 aa  101  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  30.88 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  30.88 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  33.81 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  35.03 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 		 212 aa  99.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  29.2 
 
 		 284 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  30.24 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  32.72 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 		 376 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  33.66 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 		 203 aa  98.2  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.8 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  33.95 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  34.01 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  34.3 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.36 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  38.38 
 
 		 374 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  36.56 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.8 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.12 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  30.48 
 
 		 354 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02510  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.5 
 
 		 274 aa  94.7  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115534  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.5 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  34.72 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.22 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.59 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 444 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  28.81 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  40.22 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 444 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  34.52 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.49 
 
 		 295 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.49 
 
 		 295 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  30.54 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.71 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  31.61 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 484 aa  91.7  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.89 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  34.25 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>