More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3076 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  41.43 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  40.19 
 
 		 214 aa  160  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  38.35 
 
 		 218 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  42.5 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  41.84 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  36 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.21 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  37.2 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  38.21 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  37.24 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.75 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  34.69 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  35.92 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  37.31 
 
 		 215 aa  125  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  37.19 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  36.7 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  33 
 
 		 237 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.64 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  35.68 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  32.43 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.97 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.63 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 		 236 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  32.43 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  32.83 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  32.83 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.99 
 
 		 361 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.18 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.65 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.59 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  35.57 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.92 
 
 		 263 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  34.67 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  35.79 
 
 		 344 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.07 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1750  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.18 
 
 		 263 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022513  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 243 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  35.41 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  35.57 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.38 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  34.54 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  33.67 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.47 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 304 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  35.94 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.46 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  37.43 
 
 		 356 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  33.86 
 
 		 432 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  31.05 
 
 		 346 aa  105  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.13 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  33.01 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.35 
 
 		 272 aa  104  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 246 aa  104  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.25 
 
 		 256 aa  104  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.51 
 
 		 346 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 250 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  36.26 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3552  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 483 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.6 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  32.84 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  31.84 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  28.04 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  31.96 
 
 		 250 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 244 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  35.52 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  31.31 
 
 		 345 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  36.92 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 		 298 aa  101  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.18 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  27.51 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>