More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04020 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 
222 aa  449  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  54.67 
 
 
218 aa  225  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.49 
 
 
207 aa  191  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  42.99 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 
212 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  32.85 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  38.81 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.68 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.35 
 
 
211 aa  111  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  40.29 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  37.25 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  37.13 
 
 
209 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 
211 aa  108  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.27 
 
 
201 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  37.31 
 
 
214 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  32.06 
 
 
213 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  34.47 
 
 
206 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  34.47 
 
 
206 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 
213 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
209 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  39.49 
 
 
195 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  35.82 
 
 
213 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 
205 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.55 
 
 
209 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
212 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  37.19 
 
 
236 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
210 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
213 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 
214 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
214 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 
205 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.69 
 
 
217 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 
209 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 
204 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 
206 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 
209 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 
205 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 
210 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  32.71 
 
 
213 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 
209 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  32.83 
 
 
208 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 
245 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 
215 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  31.53 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  31.53 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  34.63 
 
 
201 aa  99  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 
218 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.3 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  36.32 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  30.54 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.55 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  30.05 
 
 
209 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  30.05 
 
 
209 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  36.27 
 
 
208 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 
215 aa  95.5  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 
218 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 
209 aa  95.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 
251 aa  94.7  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  34.31 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  37.17 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 
206 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 
215 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 
213 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  35.79 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  36.27 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  34.33 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  35.33 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 
262 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  34.9 
 
 
205 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
207 aa  92  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
207 aa  92  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 
225 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 
226 aa  91.7  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0912  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.330922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>