More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2522 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  463  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  63.39 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  62.67 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  60.89 
 
 		 217 aa  254  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  61.61 
 
 		 217 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  61.61 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  59.11 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  56.7 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  57.59 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  58.22 
 
 		 218 aa  238  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  57.59 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  55.07 
 
 		 221 aa  228  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  55.13 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.13 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  58.02 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  51.95 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  54.02 
 
 		 213 aa  221  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  51.49 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.46 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  55.38 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  50.66 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.52 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  47.93 
 
 		 216 aa  185  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  49.34 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  49.34 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  46.82 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  48.9 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  46.46 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.02 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.86 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  46.7 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  46.46 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  46.54 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 195 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  35.02 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.38 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.36 
 
 		 209 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  35.32 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  35.32 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.82 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.84 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.03 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  33.5 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  31.88 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.59 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  34.83 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 		 251 aa  95.5  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.47 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.83 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.24 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.83 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.83 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.83 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.83 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  34.67 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.67 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.05 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 		 208 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  35 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  34.5 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  33 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  27.36 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  30.95 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.86 
 
 		 256 aa  85.1  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.55 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.65 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>