More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2423 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  60.98 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  59.71 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  59.71 
 
 		 225 aa  220  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  59.71 
 
 		 225 aa  220  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  55 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  55 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  54.5 
 
 		 218 aa  195  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.07 
 
 		 231 aa  194  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  55.5 
 
 		 264 aa  192  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  53.27 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  53.47 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  52.76 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  50.99 
 
 		 214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.79 
 
 		 225 aa  178  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  50.5 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  51.24 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  50.5 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  49.04 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  48.02 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  50.5 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  50.99 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  47.83 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  50.24 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  50.99 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.66 
 
 		 226 aa  168  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  48.74 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.23 
 
 		 238 aa  157  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.08 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  46.46 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.13 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  43.28 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  38.69 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.59 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.41 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  33.17 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  39.09 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  40.31 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.31 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  36.73 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  37.14 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.03 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  38.66 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  38.02 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.3 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  33.01 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  30.95 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  32.34 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2738  beta-lactamase domain-containing protein  38.3 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.86 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  30.24 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  85.5  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  34.15 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.84 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.66 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.12 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  35.45 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.82 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  34.01 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.17 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.48 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.65 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  34.54 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  38.38 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  35.03 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  36.08 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  33.85 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  34.15 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  34.16 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  36 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>