More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03910 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 214 aa  421  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.73 
 
 		 226 aa  201  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  50.68 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  49.54 
 
 		 216 aa  194  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  50.48 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  48.86 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.53 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  46.51 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  49.06 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  50.47 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  45.02 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  46.92 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  45.33 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  47.17 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  46.79 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  47.17 
 
 		 225 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  47.17 
 
 		 225 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.5 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  45.58 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  49.04 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  43.93 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  50.5 
 
 		 205 aa  168  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  46.73 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  45.79 
 
 		 203 aa  167  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  46.73 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  46.98 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  45.54 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  44.39 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.61 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.23 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  43.66 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  40.19 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  38.69 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  40.3 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  36.36 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.6 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  38.42 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  35.35 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.35 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  30.3 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.81 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.66 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.5 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  33.5 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  31.84 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.63 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  32.51 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  32.51 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  32.51 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.21 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  32.51 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  32.51 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.91 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  33 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.53 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  33 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  32.35 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  36.32 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.73 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.92 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.99 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.99 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.99 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.99 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.99 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  33.99 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.92 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  26.64 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.23 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.95 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>