More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  80.89 
 
 		 225 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  63.64 
 
 		 224 aa  276  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  64.38 
 
 		 229 aa  271  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  62.27 
 
 		 216 aa  268  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  66.99 
 
 		 203 aa  268  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  62.73 
 
 		 217 aa  261  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  62.73 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  61.88 
 
 		 221 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  62.28 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  61.36 
 
 		 217 aa  255  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  61.84 
 
 		 225 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  61.84 
 
 		 225 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  63.72 
 
 		 264 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  59.09 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  60.09 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  59.65 
 
 		 225 aa  248  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  60 
 
 		 214 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  59.19 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  57.52 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  57.92 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  57.92 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  53.81 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  55.13 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.36 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.06 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  52.91 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  52.15 
 
 		 216 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.4 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  52.5 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  48.79 
 
 		 204 aa  178  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.53 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.54 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  39.6 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  45.28 
 
 		 202 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  38.94 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.58 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.45 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  34.16 
 
 		 209 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  38.27 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.41 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  31.63 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  33.01 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  33.17 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.86 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 214 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  33.65 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.45 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  35.59 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.17 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  34.13 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  28.1 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  37.06 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 201 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  35.15 
 
 		 213 aa  95.1  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.52 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.73 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  36.22 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  36.32 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  33 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  35.03 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  31.9 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  32.84 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>