More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11653 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  79.56 
 
 
225 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  78.67 
 
 
225 aa  361  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  78.67 
 
 
225 aa  361  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  75.11 
 
 
225 aa  351  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  75.56 
 
 
225 aa  351  8e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  63.23 
 
 
226 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  63.72 
 
 
225 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  62.67 
 
 
225 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  59.71 
 
 
203 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  56.56 
 
 
221 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  57.35 
 
 
229 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  56.36 
 
 
213 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  55.86 
 
 
224 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  55 
 
 
221 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  54.55 
 
 
214 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  55.45 
 
 
217 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  54.09 
 
 
222 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  55 
 
 
217 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  54.3 
 
 
232 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  53.39 
 
 
218 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  55.5 
 
 
204 aa  204  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  51.82 
 
 
218 aa  201  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.67 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  52.13 
 
 
216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  53.62 
 
 
216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  55.88 
 
 
205 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.7 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  51.36 
 
 
216 aa  195  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.59 
 
 
238 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  46.7 
 
 
230 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.16 
 
 
226 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.17 
 
 
214 aa  168  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  40.1 
 
 
195 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.05 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  37.63 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.31 
 
 
207 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  38.74 
 
 
206 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.84 
 
 
201 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
205 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
207 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  41.38 
 
 
202 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.53 
 
 
213 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 
208 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33 
 
 
205 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
207 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.1 
 
 
229 aa  99  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 
213 aa  99.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
210 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  36.73 
 
 
210 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 
209 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.8 
 
 
218 aa  95.9  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.19 
 
 
228 aa  95.5  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 
205 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  34.2 
 
 
204 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
231 aa  95.1  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  31.5 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  35.5 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  31 
 
 
209 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  34.7 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  36.55 
 
 
211 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  34.33 
 
 
211 aa  93.6  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 
214 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.34 
 
 
208 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  32.88 
 
 
218 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  35.03 
 
 
211 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
218 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
218 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
212 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  31.66 
 
 
218 aa  89.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 
213 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 
206 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
251 aa  89  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 
213 aa  89  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2370  beta-lactamase-like  30.35 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 
215 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 
215 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
240 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  32.56 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 
212 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.16 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 
213 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  36.73 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.16 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.16 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.16 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.16 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
201 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  28.29 
 
 
213 aa  86.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
217 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.33 
 
 
222 aa  85.9  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  33.17 
 
 
214 aa  85.9  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1422  beta-lactamase-like protein  28.85 
 
 
221 aa  85.5  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 
212 aa  85.5  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.3 
 
 
215 aa  85.5  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>