More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2000 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  71.95 
 
 		 221 aa  321  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  74.77 
 
 		 213 aa  320  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  66.97 
 
 		 218 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  63.3 
 
 		 217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  63.76 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  63.3 
 
 		 217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  60.65 
 
 		 222 aa  266  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  60.65 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  64.71 
 
 		 203 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  59.72 
 
 		 218 aa  254  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  58.72 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  60 
 
 		 225 aa  245  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  60 
 
 		 225 aa  245  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  56.7 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  57.34 
 
 		 216 aa  241  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  53.64 
 
 		 224 aa  227  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  59.42 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  54.55 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  56.52 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  56.04 
 
 		 225 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  56.04 
 
 		 225 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  56.52 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.74 
 
 		 237 aa  207  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.05 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  56.19 
 
 		 205 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  54.55 
 
 		 264 aa  204  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  51.43 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  51.89 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.21 
 
 		 238 aa  187  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  50.99 
 
 		 204 aa  181  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.77 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  43.65 
 
 		 195 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.26 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  44.71 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  37.07 
 
 		 201 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  37.76 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.44 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.32 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  38.42 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 		 205 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.82 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  37.7 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.5 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  36.65 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.5 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  36.5 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  35.83 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.49 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.39 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.02 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.74 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  37.7 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.84 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  32.72 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 		 214 aa  98.6  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.03 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.36 
 
 		 204 aa  98.2  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  36.07 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.02 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  32.18 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  32.49 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  36.79 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.02 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  36.18 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  35.55 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  32.12 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.67 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.13 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  33.81 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.14 
 
 		 574 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  32.02 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  36.11 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  34.7 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  35.68 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2738  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>