More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1949 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
208 aa  427  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  45.92 
 
 
201 aa  177  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  44.33 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.42 
 
 
205 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.74 
 
 
211 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  38.73 
 
 
207 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
205 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 
213 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 
198 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 
205 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  38.17 
 
 
216 aa  136  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 
210 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  39.49 
 
 
212 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  37.97 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  40.33 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  36.46 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  36.32 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
211 aa  125  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  35.61 
 
 
206 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 
209 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 
251 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 
206 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 
210 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.87 
 
 
209 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.07 
 
 
209 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 
210 aa  121  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  34.67 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  36.22 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  36.27 
 
 
208 aa  119  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  34.67 
 
 
209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.63 
 
 
210 aa  118  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  34.17 
 
 
209 aa  118  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
220 aa  118  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  34.17 
 
 
209 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  34.17 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  35.33 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  34.17 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.95 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  33.02 
 
 
207 aa  116  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  34.87 
 
 
246 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
217 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 
245 aa  115  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  33.17 
 
 
217 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.81 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  31.31 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  29.91 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  34.17 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  34.17 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
209 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  30.59 
 
 
231 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.05 
 
 
213 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  35.03 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 
229 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 
213 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 
214 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.06 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  33.16 
 
 
210 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 
210 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 
210 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  30.29 
 
 
210 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 
209 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 
213 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 
214 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 
213 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 
210 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  29.05 
 
 
219 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 
214 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 
208 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 
213 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 
214 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 
234 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  36.18 
 
 
200 aa  106  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 
238 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 
214 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 
231 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.84 
 
 
218 aa  105  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 
215 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
237 aa  104  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 
214 aa  104  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 
231 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  32.8 
 
 
214 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>