More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0199 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  100 
 
 
200 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  46.94 
 
 
200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  49.21 
 
 
200 aa  182  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  45.51 
 
 
199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  42.37 
 
 
191 aa  144  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  35.96 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  33.67 
 
 
213 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 
214 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  36.18 
 
 
208 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 
216 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  38.36 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 
208 aa  95.5  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  42.47 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  37.78 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.05 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.48 
 
 
251 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.02 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  38.41 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.4 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  39.73 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  35.76 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35.18 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36.05 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  35.63 
 
 
231 aa  88.2  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  33.52 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.66 
 
 
201 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  39.72 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 
209 aa  85.9  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.62 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.25 
 
 
211 aa  84.7  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  36.11 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  36.77 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.25 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2544  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143017  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  33.89 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  34.44 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  31.69 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.58 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  34.44 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.58 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.58 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.11 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.97 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.58 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.58 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  32.99 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  33.53 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  30.72 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.21 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  35.21 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  33.77 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  37.59 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  34.51 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  34.46 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  34.51 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  34.51 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  34.51 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  34.51 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  33.77 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.62 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  34.06 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  34.51 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  31 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  34.51 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  33.93 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  32.53 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>